מיום 1.1.07 מוסמכת מועצת הרשות לקבוע את חקיקת המשנה ("כללים") ליישום המדיניות בנושאי מים וביוב.
החוקים העיקריים מכוחם פועלת מועצת הרשות:
• חוק המים, תשי"ט- 1959.
• חוק תאגידי מים וביוב, תשס"א-2001.
• חוק הפיקוח על קידוחי מים, תשט"ו-1955.
• חוק מדידת מים, תשט"ו-1955.
• חוק ההסדרים לשנים 2010-2011.
תחומי פעילות ואחריות עיקריים לפי החוקים האמורים:
• הסדרת משק המים, פיתוחו ופיקוח עליו;
• ביצוע מדיניות הממשלה שיש לה השלכות על משק המים;
• קביעת כללים למתן רישיונות לפי חוק זה;
• קביעת תעריפים והיטלים לשימושי המים השונים;
• קביעת אמות מידה לשירות שעל ספק מים וביוב לתת לצרכניו;
• קביעת כללים בדבר הפקת מים, הספקתם, כמותם, איכותם, מחירם, השימוש בהם במסגרת מטרות המים, ואירוע פגיעה במים;
• קביעת תקנים לטיפול במי שפכים;
• פיקוח על רשות המים הארצית ורשויות המים האזוריות;
• סיוע לשר התשתיות הלאומיות במילוי תפקידו כשר היוזם לעניין אמנות בין-לאומיות בנושא מים.